Σε μικρή απόσταση από το λιμάνι της Ίου, κοντά στον λόφο που βρίσκεται η σημερινή Χώρα, η αρχαιολογική σκαπάνη έφερε στο φως έναν από τους σημαντικότερους πρωτοκυκλαδικούς οικισμούς (2.800 π. Χ.), που είχε μεγάλες εμπορικές σχέσεις με τα άλλα νησιά. Η κατάσταση διατήρησής του, μας επιτρέπει να γνωρίσουμε ένα πολύ αναπτυγμένο οικισμό με εξελιγμένη αρχιτεκτονική, μιας και διαθέτει διώροφα κτίρια, οργανωμένο πολεοδομικό σύστημα, καθώς και αποχετευτικό δίκτυο. Στις ανασκαφές βρέθηκαν πολλά μεταλλικά, οστέινα και λίθινα σκεύη και εργαλεία, εντυπωσιακά πήλινα αγγεία, καθώς και ένας μεγάλος αριθμός ενσφράγιστων αντικειμένων, σπάνιο για Πρωτοκυκλαδικό οικισμό. Ο αρχαιολογικός χώρος του Σκάρκου έχει βραβευθεί από την Ευρωπαϊκή Ένωση και την Europa Nostra για την υποδειγματική αναστήλωσή του και ανάδειξή του.