Η μικρή έκταση του νησιού δίνει τη αίσθηση πως μπορείς να πας όπου επιθυμείς με τα πόδια. Μονοπάτια που σας φέρνουν κοντά στη φυσική ομορφιά του νησιού είναι τα παρακάτω:
Παναγία-κορυφή Πάπα: Μια διαδρομή που καταλήγει σε σημείο με πανοραμική θέα σε πολλά γειτονικά νησιά, όπως και θέα προς την ίδια την Ηρακλειά. 2.070 μ.Παναγία-Φτερό Μέριχα: 1.570 μ.
Παναγία-Σπήλαιο Αγίου Ιωάννη: Από τις πιο γνωστές διαδρομές του νησιού. 2.610 μ
Αγ. Αθανάσιος-Σελλάδι: 1.080 μ.
Αβέρου-Σπήλαιο Αγίου Ιωάννη: 1.460 μ.
Άγιος Γεώργιος-Άγιος Αθανάσιος: 2.900 μ.
Άγιος Γεώργιος-Παραλία Βορεινή Σπηλιά: 1.300 μ.
