Στον δρόμο προς τα Πολλώνια υπάρχουν τα ευρήματα της αρχαίας πόλης της Φυλακωπής, η οποία είναι από τους σημαντικότερους οικισμούς του Κυκλαδικού πολιτισμού και η σημαντικότερη πόλη του προϊστορικού Αιγαίου. Κατοικήθηκε διαρκώς από τα τέλη της 3ης χιλιετίας π.Χ έως την μυκηναϊκή εποχή (14ος αι π.Χ) οπότε ιδρύεται ένα μεγαλόσχημο ηγεμονικό κτίριο, που μοιάζει με τα ανάκτορα της ηπειρωτικής χώρας. Το κτίριο  περιλαμβάνει πολλά δωμάτια, διαδρόμους και κεντρική εστία.
Έγινε μεγάλο εμπορικό και πολιτιστικό κέντρο χάρη στο εμπόριο της πολύτιμης πέτρας του οψιδιανού, αναπτύχθηκε ραγδαία, απέκτησε δύναμη, όρθωσε κυκλώπεια τείχη για τους εισβολείς, καταστράφηκε και αναστήθηκε τρεις φορές. Σήμερα το μεγαλύτερο μέρος της πόλης βρίσκεται κάτω από την επιφάνεια της θάλασσας, αλλά αξίζει να την επισκεφτείτε για να θαυμάσετε ότι σώζεται από το επιβλητικό κυκλώπειο τείχος του οικισμού. Ευρήματα του οικισμού μπορείτε να δείτε στο Αρχαιολογικό μουσείο Μήλου. Ωράριο λειτουργίας: Καθημερινά 8.30-15.00 εκτός Δευτέρας. Είσοδος: Ελεύθερη