Ο εντοπισμός ενός λιωμένου μετάλλου, του λεγόμενου ζιρκονίου, οδήγησε στο συμπέρασμα πως οι δύο λίμνες δεν προήλθαν, όπως πίστευαν, από έκρηξη ηφαιστείου, αλλά από τη πτώση μετεωρίτη στη γη πριν από περίπου 10.000 χρόνια, που δημιούργησε δύο δίδυμους κρατήρες. Γι’ αυτόν το λόγο οι λίμνες Ζερέλια αποτελούν πόλο έλξης για πολλούς γεωλόγους. Απέχουν η μία από την άλλη 250 μ. Η μεγαλύτερη έχει διάμετρο μέχρι 300 μ. και βάθος περίπου 8 μ. ενώ η μικρότερη έχει διάμετρο μέχρι 250 μ. και βάθος περίπου 6 μ. Μέχρι σήμερα γίνονται πολλές έρευνες για την εύρεση του μετεωρίτη. Εκτός του ότι συνθέτουν έναν εξαιρετικό υδροβιότοπο, οι δύο λίμνες έχουν και μεγάλο αρχαιολογικό ενδιαφέρον, λόγω παλιάς πληροφορίας που αναφέρει ότι σε μια από αυτές βρισκόταν ο ναός της θεάς Ιτωνίδος. Νοτιοδυτικά του Αλμυρού.