Είναι ο Καθεδρικός Ναός του νησιού και θεωρούνταν η Μητρόπολη των Ψαρών. Βρίσκεται σε κεντρικό σημείο της Χώρας, προς την πλευρά του λιμανιού. Είναι μια τρίκλιτη κιονοστήρικτη τρουλαία βασιλική με υπερώο αλλά χωρίς νάρθηκα.
Χτίστηκε πριν το 1770 (Ρώσοι ιερείς λειτούργησαν σε αυτή την εκκλησία). Οι διαστάσεις της είναι μικρότερες από εκείνες του μνημειώδους ναού του Αγίου Νικολάου. Παραστάδες και τυφλά αψιδώματα απαρτίζουν τον επιτοίχιο διάκοσμό του. Η κατάνυξη που προκαλεί ο χώρος είναι ιδιαίτερη.
Ο ναός της Μεταμορφώσεως είναι ένα ακόμα από τα πολλά κτίσματα που καταστράφηκαν στο Ολοκαύτωμα. Οι επισκευές του όμως, με δωρεές των κατοίκων, ολοκληρώθηκαν το 1885. Την πληροφορία επιβεβαιώνει η επιγραφή στο υπέρυθρο του εκκλησιαστικού κτίσματος.