Κοντά στο ιερό των Καβειρίων υπάρχει η σπηλιά του Φιλοκτήτη. Σύμφωνα με τον μύθο, οι Αχαιοί πηγαίνοντας προς την Τροία σταμάτησαν στη Λήμνο και εγκατέλειψαν εκεί τον Φιλοκτήτη, τον οποίο είχε δαγκώσει ένα φίδι, με αποτέλεσμα το πόδι του να αναδίδει μια ανυπόφορη δυσοσμία. Οι επισκέπτες της σπηλιάς μπορούν να απολαύσουν ένα μπάνιο στα γαλάζια νερά της σπηλιάς.