Στεγασμένη σε ένα κτήριο του 1899, τη λεγόμενη Οθωμανική Σχολή, η αρχαιολογική συλλογή στην Ιεράπετρα ιδρύθηκε το 1986 και περιλαμβάνει ευρήματα από την πόλη αλλά και από τη γύρω περιοχή, που χρονολογούνται από τη μινωική εποχή έως τα ρωμαϊκά χρόνια. Αρκετά εκθέματα του μουσείου έχουν κλαπεί ή έχουν καταστραφεί κατά τη διάρκεια της κατοχής. Ωράριο λειτουργίας: Καθημερινά 8:30-15:00 εκτός Δευτέρας.