Βρίσκεται στα Μεγάλα Χωράφια, πάνω από τον κόλπο της Σούδας. Η Αρχαία Άπτερα άκμασε την ελληνιστική περίοδο αλλά ίχνη κατοίκησης υπάρχουν αδιάκοπα από τα Μινωικά χρόνια. Σήμερα ο επισκέπτης μπορεί να δει στην αρχαία ακρόπολη τμήματα του ελληνιστικού τείχους, ίχνη από το ρωμαϊκό θέατρο που έχει μερικώς αποκαλυφθεί αλλά και το καλοδιατηρημένο ρωμαϊκό υδραγωγείο, που εντυπωσιάζει για την κατασκευή και το μέγεθός του. Ανατολικά της Αρχαίας Άπτερας, στην κορυφή του λόφου, υψώνεται το τούρκικο φρούριο (Κουλές), το οποίο το καλοκαίρι χρησιμοποιείται για πολιτιστικές εκδηλώσεις.