Εάν ταξιδεύετε με ιστιοπλοϊκό, έκτος από τους αμέτρητους κόλπους στις ακτές του νομού αλλά και στα μικρά νησάκια ανοιχτά του Αστακού, υπάρχουν πολλές μαρίνες όπου θα μπορούσατε να δέσετε και να φροντίσετε για τις προμήθειες σας. Η καινούργια μαρίνα στο Μεσολόγγι, όπου σύντομα αναμένεται να λειτουργεί και σχολή εκμάθησης ιστιοπλοΐας, στο Αστακό, στον Μύτικα και βέβαια στην Πάλαιρο και την Βόνιτσα είναι τα βασικότερα λιμάνια στο νομό.