Μια μικρή μονή η οποία χωρίς να υπάρχουν σαφείς ενδείξεις, ανάγεται στα τέλη του 16ου αιώνα. Σύμφωνα με την επιγραφή στην εξωτερική πλευρά της πόρτας του ναού: «τελειωθεί δια χειρός του μαστρό Νικόλα μηνός Οκτωβρίου 10 1611 ανεγέρθη το έξωθεν τοιχόκαστρο του μοναστηρίου δια εξόδου και συνδρομής πανοσιολογιοτάτου καθηγούμενου Κίρου ιερομόναχου και ιερέως εις μνημόσυνο αυτού». Εάν λοιπόν το τείχος χτίστηκε στα 1611, το καθολικό της μονής πρέπει να χτίστηκε νωρίτερα, ίσως στα τέλη του 16ου αιώνα. Σύμφωνα με τον Μιχαήλ Δέφνερ υπήρχε μια επιγραφή στο υπέρθυρο της εισόδου του ναού που βεβαίωνε ότι το καθολικό της μονής ιστορήθηκε «δια χειρός ζωγράφου Δαμασκηνού ιερομόναχου και Δημητρίου εξ Ιωαννίνων». Οι αγιογράφοι αυτοί ήρθαν στο νησί από τη μονή Μεγίστης Λαύρας σταλμένοι από τον ηγούμενο της Τιμόθεο ο οποίος καταγόταν από τη Σκύρο.