Ο ναός της Παναγία της Επισκοπής, αφιερωμένος στην Κοίμηση της Θεοτόκου είναι από τις σημαντικότερες εκκλησίες της Σαντορίνης, που για πολλά χρόνια διεκδικούσαν ορθόδοξοι και καθολικοί. Ανεγέρθη, όπως εικάζεται, τον 11ο αι. από τoν Αλέξιο Α' Κομνηνό και στο εσωτερικό της είναι εμφανή τα υπολείμματα προγενέστερου ναού με τμήματα αυτού όπως και γλυπτά που έχουν ενσωματωθεί στο μεσοβυζαντινό ναό. Στο εσωτερικό του μπορείτε να θαυμάσετε τις υπέροχες εικόνες, δυστυχώς πολλές από τις οποίες εκλάπησαν το 1982, αγιογραφίες καθώς και το πελεκητό, μαρμάρινο τέμπλο της. Στο ναό παραμένει η εικόνα της Παναγίας της Γλυκοφιλούσας, η οποία ήταν λιτανευτική εικόνα στα τείχη της Κωνσταντινούπολης και δόθηκε τον 11ο  αι. στο ναό της Επισκοπής. Η σημερινή ωστόσο εικόνα του ναού, είναι διαφορετική από αυτή του 11ου αι. μιας και έχουν γίνει προσθήκες, όπως το καμπαναριό. Το σημαντικό αυτό Βυζαντινό μνημείο βρίσκεται στη Μέσα Γωνιά στο δρόμο προς το Καμάρι.